5 automatizuota karyotipų kūrimo programinė įranga, skirta jūsų chromosomoms nustatyti

Kariotipų sudarymas yra visų organizme randamų chromosomų užsakymo ir suporavimo procesas, siekiant gauti visapusišką viso žmogaus chromosomų žemėlapio vaizdą.

Bet pirmiausia įsitikinkime, kad suprantame, kokios yra chromosomos. Chromosomos yra struktūros, kurios atrodo panašios į temas, esančias kiekvieno kūno ląstelių branduolyje.

Kiekvienoje chromosomų struktūroje yra visas jūsų kūno genetinės informacijos planas. Tai diktuoja, kaip jūsų kūnas yra struktūrizuotas, reaguoja į dirgiklius, polinkis į ligas ir pan. Moterims yra 2 „X“ chromosomos, o vyrams - viena „X“ ir viena „Y“ chromosoma. Kiekvienoje kūno ląstelėje yra 23 porų chromosomų, iš viso 46 chromosomos.

Kad mokslininkai galėtų suprasti kiekvieno paciento chromosomų sekas, jie naudoja programinę įrangą karyotype . Ši programinė įranga skirta atlikti chromosomų analizę ir įvertina žmogaus chromosomų struktūrą ir skaičių. Tai darydami mokslininkai ir mokslininkai gali aptikti anomalijas.

Šiame straipsnyje mes ieškosime puikių programinės įrangos parinkčių, leidžiančių atlikti kariotipų analizę.

5 geriausi automatizuoti kariotipų kūrimo įrankiai, naudojami 2019 m

ArgusSoft

„ArgusSoft“ yra puiki programinė įranga, leidžianti automatiškai karyotipuoti žmogaus chromosomas pagal juostos padėtį, taip pat galima naudoti gyvūnų ir augalų chromosomų internete karyotype.

Pagrindiniai bruožai:

G, Q, R dažymas
Automatizuotas žmogaus chromosomų karyotipavimas, atpažįstant lenkimus
Automatinis kiaulių chromosomų karyotipavimas
3 įmontuotos standartinės žmogaus chromosomų ideogramų bazės, turinčios įvairius aiškumo lygius - 400, 550 ir 850 lygių
Gali papildyti standartinių kromosomų ideogramų pagrindus kitoms gyvūnų ir augalų rūšims
Mėginių paruošimo metodai
Metafazių plokščių vaizdų įvedimas naudojant fotoaparatą ir skaitytuvą
Pridedamas vaizdas su grafika
Automatinis taikomų ir kontaktuojančių chromosomų padalijimas
Chromosomų ir ideogramų palyginimas

ArgusSoft taip pat galite mokyti chromosomų atpažinimo sistemą iš anksto nustatytais preparatais, galite perkelti metafazių plokščių atvaizdus ir kariogramas integruotoje duomenų bazėje, sukurti ataskaitų modelius, koreguoti kariogramas, taip pat išsaugoti ir spausdinti vaizdus bei analizės rezultatus.

Jūs galite gauti mokymą ir paramą, naudodami „ArgusSoft“ savo oficialioje svetainėje. Į paramos centrą įeina mokymo, priežiūros ir konsultavimo paslaugos.

Išbandykite „ArgusSoft“

„HiBand“ pagal taikomą spektrinį vaizdavimą

„HiBand“ yra „Applied Spectral Imaging“ sukurta programinė įranga, kuri gali atlikti išplėstinę chromosomų analizę, naudodama skaitmenines kariotipų savybes. Ši programinė įranga

naudoja automatines nuskaitymo funkcijas, kad būtų galima atlikti išsamią chromosomų struktūros analizę.

Galite naudoti platų funkcijų, rastų „HiBand“, spektrą indeksavimo, skaičiavimo, saugojimo ir valdymo duomenų valdymui. Šią galingą programinę įrangą taip pat galite naudoti automatiškai nuskaityti chromosomų seką.

Rezultatų, gautų naudojant karyotyping ypatybes, HiBand galima saugoti saugioje vietoje su slaptažodžiu apsaugotais ir šifruotais sluoksniais. Tai leidžia jums ramiai prarasti svarbius sekos duomenis ir dėl to taip pat pagerina laboratorijos efektyvumą.

Rezultatų rūšiavimas atliekamas labai paprasta, tiesiog reikia ieškoti konkrečios chromosomų sekos, o visi rezultatai rodomi gerai matomame ekrane, kuris suteikia galimybę lengvai keisti, peržiūrėti ir pridėti žymes bet kuriam rinkmenų.

Pagrindiniai bruožai:

Brightfield Karyotyping-G-Band ir R-Band
Fluorescencinis kariotipas-Q-Band, R-Band ir FISH
Spektrinis kariotipas
Automatinis chromosomų skaičiavimas
Chromosomų indeksavimas ir klasifikavimas
Išplėstinis chromosomų atskyrimas ir pažangus vaizdo pagerinimas
Vaizdų galerija - gali pateikti visus atvejus metafazes ir kariotipus viename ekrane
Gali palyginti chromosomas - matyti jas šalia
„Abberant Ideogram“ - galite pridėti chromosomų, ląstelių, ideogramų ir anotacijų vaizdų generatoriuje

„HiBand“ naudoja visiškai automatizuotas darbo eigos, kad padidintų laboratorijos efektyvumą, turi nuskaitymo funkcijas „pradžios ir pėsčiomis“, nustato metafazes, automatiškai perskaito brūkšninius kodus, perkelia vaizdus realiu laiku skaidrių nuskaitymo metu ir eksportuoja į laboratorijos LIS centrinį portalą ir Duomenų bazė.

Išbandykite „HiBand“

„Ikaros“ pagal „MetaSystems“

Ši karyotipavimo sistema turi labai intuityvią vartotojo sąsają, kuri siūlo visas funkcijas viename ekrane. Tai leidžia lengvai ir greitai gauti visą gautą informaciją.

„Ikaros“ galima naudoti su „Neon“, kuri yra platforma, skirta padėti atvaizdams ir bylų organizavimui. „Neon“ renka duomenis iš visų atvaizdavimo darbų, išorinių šaltinių ir leidžia juos lengvai suprasti, naudojant atvejo valdymo prietaisų skydelį.

Šis įrankis leidžia jums visada turėti svarbią informaciją, saugią ir saugią, tačiau naudoja labai stiprius duomenų valdymo algoritmus, turi keletą būdų, kaip stebėti duomenis ir teikti konkrečias paieškas pagal raktinius žodžius ir duomenų charakteristikas.

Daugiau informacijos apie „Neon“ ir jo funkcijas rasite čia .

„Ikaros“ palaiko daug skirtingų juostų kūrimo būdų - „Brightfield G-Band“ ir „R-Band“, „Fluorescence Q-Band“, „R-Band“ ir „FISH“, siūlo daugybę iš anksto nustatytų kariogramų formų žmonėms, augalams ir gyvūnams. Galite lengvai redaguoti šias formas, kad galėtumėte pridėti bet kokių duomenų, reikalingų atlikto tyrimo tipui.

Tai, kad galite palyginti chromosomas pagal klasę arba kariogramas, suteikia jums labai naudingos informacijos, kuri leidžia lengvai nustatyti skirtumus.

Išbandykite Ikaros

„Microptic“ „MetaClass“

„MetaClass“ yra puiki karyotyopinė programinė įranga, sukurta moduliniu būdu. Ši programinė įranga padeda atlikti karyotipų ir FISH tyrimus chromosomoms.

„MetaClass“ yra sudarytas iš šių modulių:

„MetaClass“ duomenų bazė

Duomenų bazė, kurią galima įdiegti su bet kuriuo „MetaClass“ moduliu. Leidžia saugoti paciento duomenis ir suteikia jums galimybę lengvai pasiekti rezultatus. Su šiuo moduliu galite kurti tinkintas ataskaitas bet kuria kalba.

MetaClass Karyotyping

Leidžia studijuoti kariotipą po to, kai buvo užfiksuoti metafazės paruošimo etapo vaizdai, ir suskirstyti juos į poras pagal dydį, padėtį ir pan. Šis modulis suteikia puikių kokybės rezultatų, kai kalbama apie chromosomų juostas, ir taip pat gali būti teikti jums profesionalias ataskaitas.

Pagrindinės funkcijos:

Kariotipo tyrimas analizuojamas pagal 100x didinimo lauką
Gali užfiksuoti kelis metafazinius vaizdus
Vaizdo kokybė gali būti modifikuota, kad rezultatai būtų ryškesni
Automatinis chromosomų klasifikavimas
4 ekrano vaizdai - metafazė, karyotipas ir neklasifikuotas chromosomų langas
Gali rodyti chromosomų prototipus
Chromosomos, kurios nėra klasifikuojamos, gali būti automatiškai arba rankiniu būdu pataisytos - viršutinės pozicijos, atskyrimas, sankryžos, sukimas ir kt.
MTC sesijos failus arba BMP vaizdus galima išsaugoti ir perkrauti bet kuriuo metu
Gali eksportuoti atskiras chromosomas į „Metaclass“ duomenų bazę su galimybe pridėti komentarus ir pastabas

Štai metaklasės kariotipų ataskaitos pavyzdys.

MetaClass FISH

Tai analizės modulis, leidžiantis gauti fluorescencinį IN SITU hibridizacijos (FISH) vaizdą. Šis modulis fiksuoja vaizdus naudojant fluorescencinius DNR zondus ir leidžia patvirtinti genetinius sutrikimus - trisomijas, makrodelekcijas, chromosomų pertvarkymus ir pan.

FISH vaizdai analizuojami po 100X didinimo ir, siekiant didesnio vaizdo aiškumo, taip pat gali užfiksuoti vaizdus su skirtingais filtrais.

Jei norite sužinoti daugiau informacijos apie anksčiau pateiktus modulius ir kitas funkcijas, galite peržiūrėti „MetaClass“ katalogą.

Jei esate įdomus ir norite pamatyti ataskaitą, gautą naudojant FISH metodą

PDF failo pavyzdys.

Išbandykite „MetaClass“

„GenASis Bandview“

„GenASis Bandview“ yra dar viena didelė karyotipų kūrimo programinė įranga, sukurta iš įvairių modulių turinčių modulių. Šią programą galite naudoti karyotipų diagnostikai atlikti ir gauti tikslius bandymų rezultatus.

Ši programinė įranga leidžia jums visiškai pritaikyti darbo eigą ir diagnozavimo procesą, priklausomai nuo jūsų įmonės poreikių ir siekiamų tikslų.

Platus „BandView“ įrankių asortimentas yra lengvai pasiekiamas tik vienu pelės paspaudimu ir siūlo galingą G / R / C / Q-Band kariotipų kūrimo patirtį. Galite pasirinkti tarp automatinio arba rankinio darbo eigos, kai reikia ieškoti metafazių ir fotografuoti.

Chromosomos anomalijos, jei jos randamos, gali būti stebimos papildant, išbraukiant arba pertvarkant paciento genetinę medžiagą. Su „BandView“ galite naudoti FISH molekulinės technikos juostą.

FISH naudoja fluorescencinius zondus, skirtus prijungti prie skirtingų chromosomos dalių, leidžiant programinei įrangai aptikti ir lokalizuoti specifinių DNR sekų aptiktus anomalititus.

Išbandykite „GenASis Bandview“

Išvada

Šiame straipsnyje išnagrinėjome kai kurias geriausias automatizuotas karyotipų kūrimo programas, egzistuojančias rinkoje 2018 m. Pabaigoje.

Šiame straipsnyje nurodyti kariotipų kūrimo būdai siūlo įvairias funkcijas, kurios padės pasiekti jūsų įmonės tikslus.

Naudodamiesi šios rūšies programine įranga galite greitai skaičiuoti tūkstančius chromosomų struktūrų, analizuoti su įvairiais profesionaliais metodais ir pateikti aukštos kokybės ataskaitas, kurios leis jums lengvai nustatyti bet kokius anomalijas.

Mes norėtume sužinoti, kokia jūsų nuomonė yra apie programinę įrangą, kurią pateikėme šiame 5 aukščiausiame sąraše. Nedvejodami praneškite mums, naudodami toliau pateiktą komentarų skyrių.

SUSIJUSIOS GAIRĖS, KURIEMS REIKIA PATIKRINTI: